Foto: Luan Teixeira/UFPA
Um estudo recém-publicado na Revista Nature Communications apresenta um método inovador para a montagem de genomas, que é o conjunto de informações hereditárias presentes no DNA ou, em alguns vírus, no RNA. A pesquisa intitulada ‘Sequenciamento direcionado e montagem iterativa de genomas quase completos’ foi desenvolvida por uma colaboração internacional que inclui os professores Renata Coelho Rodrigues Noronha e Luís Adriano Nascimento, da Universidade Federal do Pará (UFPA).
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Batizada de Cornetto, a nova técnica combina sequenciamento direcionado e procedimentos iterativos de reconstrução para gerar genomas praticamente completos com maior eficiência. Diferentemente dos métodos tradicionais, que produzem grandes volumes de dados sem distinção, o Cornetto utiliza o sequenciamento por nanoporo, uma tecnologia que lê moléculas de DNA ao fazê-las passar por poros minúsculos e medir variações de corrente elétrica, de forma seletiva, focando nas regiões genômicas que permanecem incompletas após a primeira montagem.
A abordagem consiste em identificar trechos problemáticos, muitas vezes regiões repetitivas ou de difícil leitura, e direcionar novos ciclos de sequenciamento especificamente para essas áreas. Esse processo é repetido até que o genoma apresente alta completude, reduzindo custos e aumentando significativamente a qualidade do resultado final.
Participação de profissionais da UFPA
De acordo com o estudo, a técnica mostrou-se eficaz na diminuição de lacunas comuns nas metodologias convencionais.
“Trata-se do desenvolvimento mais rápido e eficiente de análise, que ajuda a entender melhor como as atividades desenvolvidas pelo homem podem influenciar o meio ambiente e as características dos seres vivos aqui da Amazônia, como os peixes”, explica o professor Luís Adriano.
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A professora Renata Noronha destaca a relevância do avanço: “O desenvolvimento e a implementação do Cornetto ampliam significativamente as capacidades da pesquisa genômica na Amazônia, fornecendo uma ferramenta poderosa para o monitoramento e a proteção do ecossistema local com maior precisão e eficiência. Essa integração entre tecnologia de ponta, biodiversidade regional e cooperação internacional abre novos caminhos promissores para a conservação ambiental e para a compreensão dos efeitos das atividades humanas no bioma amazônico”.
Aplicações de genomas na Amazônia
Uma das aplicações mais promissoras do Cornetto foi seu uso no sequenciamento do genoma de um peixe nativo da Amazônia. Com a técnica, foi possível obter, pela primeira vez, o genoma de alta cobertura de Geophagus surinamensis, um ciclídeo típico da região.
Segundo a professora Renata Noronha, a espécie foi selecionada por estar sujeita a impactos ambientais significativos, o que a torna um organismo modelo relevante para estudos ecológicos e genéticos.
“Com esse sequenciamento detalhado, será possível analisar genes associados à resposta a diferentes tipos de poluição. Assim, os resultados abrem caminho para monitorar os efeitos das alterações ambientais e compreender como esses peixes se adaptam — ou são afetados — pelas mudanças provocadas por atividades humanas”, destaca a professora na UFPA.
Confira a pesquisa completa aqui.
*Com informações da UFPA
