O trabalho de monitorização visa determinar o estado da qualidade da água e avaliar a deterioração ambiental causada pelas atividades antrópicas na bacia.
A Reserva contribuirá para proteção dos direitos fundamentais, direitos coletivos e o uso e manejo dos recursos naturais para a subsistência dos povos indígenas.
Os esforços de conservação se concentram no rastreamento e proteção de habitats ameaçados de onças-pintadas e outros grandes felinos usando tecnologia espacial.