As 1.053 áreas protegidas na Amazônia Legal são formadas por 430 unidades de conservação ambiental, 378 terras indígenas e 245 territórios quilombolas.
O principal objetivo é gerar informação sobre o estado atual da qualidade da água nessas áreas protegidas de Madre de Dios, servindo de base para promover a sua conservação e gestão sustentável.